Aus Versehen löst Nager Scrat eine Kontinentalverschiebung aus. Mammut Manny, Säbelzahntiger Diego und Riesenfaultier Sid werden so von ihrer Herde getrennt und treiben aufs offene Meer hinaus. Dabei begegnen die Freunde allerlei exotischen Meeresbewohnern und müssen ihren gesamten Heldenmut aufbringen, um einige rücksichtslose Piraten zu bekämpfen.