Blu, Jewel und ihre drei Kinder verlassen die magische Großstadt Rio, um in der Wildnis des Amazonas nach ihren Vorfahren zu suchen. Insbesondere Stadtvogel Blu fällt es schwer, sich in der völlig fremden Umgebung zurechtzufinden. Während er versucht, Nigels hinterhältigem Racheplan zu entgehen, trifft er auf einen weiteren furchterregenden Gegner - seinen Schwiegervater.