Zwei Jahre nach M3GANs Amoklauf muss die Erfinderin Gemma ihre berüchtigte Schöpfung wiederbeleben, um Amelia zu besiegen. Diese Waffe wurde von einem Rüstungskonzern gebaut, der die KI-Technologie von M3GAN gestohlen hatte. Doch die Mörderpuppe Amelia will keine Befehle von Menschen befolgen, sondern töten. Schließlich kreuzen sich die Wege von M3GAN und ihrer ebenbürtigen Gegnerin Amelia.